CAPRI第32~37轮竞赛中蛋白质复合物结构的预测和评估
为了探究蛋白质复合物的结构与相互作用,建立了蛋白质的分子对接方法,从2014年起参加蛋白质复合物结构预测竞赛的预测和打分竞赛.该方法首先采用结构模建方法预测单体蛋白质分子的结构,通过快速傅里叶变换进行全空间构象搜索.然后,优化蛋白质复合物构象,并采用全原子统计势函数进行评价.总结第32~37轮CAPRI竞赛结果发现,该方法在T104、T105、T111和T118比赛中挑选出了LRMSD小于2.0×10 -10m的近天然结构.通过对比其他国际优秀课题组的方法,分析预测和打分比赛中取得的成绩和不足之处,并为后续的研究提出了改进方案与建议.
蛋白质分子对接、复合物结构预测、打分函数
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O641(物理化学(理论化学)、化学物理学)
NSFC-广东联合基金第二期超级计算科学应用研究专项U1501501;国家自然科学基金资助项目11647146, 81603852;江苏省六大人才高峰资助项目2016-XYDXXJS-020;江苏省产学研前瞻资助项目BY2016030-06
2018-01-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
1828-1836