基于残基涨落的加权氨基酸网络的构建及应用
提出了一种以残基间距离涨落为权重的氨基酸网络的加权方式.对180个蛋白质的加权与非加权氨基酸网络的拓扑特征量进行了分析.统计结果表明,氨基酸网络具有明显的小世界特征,加权网的平均集聚系数比非加权网的小.节点度分布具有幂律形式,显示了网络的层次模块性,进一步发现疏水残基对这一性质起了主要作用.另外,加权网的介数对折叠核的区分能力强于非加权网,表明加权网较非加权网包含了更多的蛋白质结构信息.
氨基酸网络、残基涨落、小世界特性、幂律分布
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Q61(理论生物物理学)
国家自然科学基金30670497
2011-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1695-1699
