10.3969/j.issn.1671-3141.2022.99.012
结肠腺癌诊断与预后相关关键基因的鉴定
目的 运用生物信息学技术鉴定新的用于结肠腺癌诊断和预后评估的生物学标志物。方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus，GEO)中下载3个结肠癌基因表达谱数据，利用GEO2R工具对差异表达基因(Differential expression genes，DEGs)进行分析。采用WebGestalt在线工具进行差异表达基因功能及通路富集研究。采用SRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白相互作用(PPI)网络构建并使用MCC算法从蛋白相互作用网络中筛选出前20个关键基因。采用GEPIA2在线工具从20个基因中筛选影响预后的基因。最后，使用TCGA-COAD临床数据集验证核心基因的表达水平和诊断意义。结果 本研究共筛选了413个差异表达基因，通过构建蛋白相互作用网络，我进一步筛选出20个关键基因，并通过生存分析选择了其中3个有预后价值的基因。最后，用TCGA-COAD数据集的临床分析，验证了这些核心基因的诊断价值。结论 SPP1、GRP和GNGT1在结肠腺癌中高表达，可作为诊断与预后评估的标志物。
结肠腺癌、生物标志物、诊断、预后、SPP1、GRP、GNGT1
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R446.1, R735.3(诊断学)
^A无锡市科技发展医疗卫生指导性计划项目^B（NZ2019042）^D1
2023-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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